يقع متحف نجران الإقليمي في الركن الشمالي الغربي لموقع الأخدود الأثري، وبُني عام 1403هـ/1983م وافتُتح للزوار عام 1407هـ/1987م تحت مظلة هيئة المتاحف. يضم خمس قاعات عرض: صالة المدخل، وعصور ما قبل التاريخ، وما قبل الإسلام، والعصر الإسلامي، وتوحيد المملكة، إلى جانب مكتبة ومختبرات ترميم.
يمتد أمام مدخله ممشى بطول 1,200 متر يضم أكشاكًا تجارية، ويستقبل الرحلات المدرسية وزوار الأخدود على مدار العام.
